Als gelernte Schauspielerin arbeitete sie unter anderem am Hessischen Staatstheater Wiesbaden und am Theater der Keller in Köln.
Von der Spielzeit 2010/11 bis 2017/18 war sie gemeinsam mit Oda Zuschneid Künstlerische Leiterin des Jungen Theaters am Hessischen Landestheaters Marburg.
Annette Müller arbeitet außerdem als Regisseurin und freie Dramaturgin und schreibt Kinder- und Jugendstücke.
